W 1726 roku usunięto z kościoła pierwotny gotycki ołtarz, a 9 stycznia 1727 roku hrabia Anton Eszterházy polecił ustawić trzy barokowe ołtarze, po jednym w każdej nawie. Pozostają w kościele do dziś. Za ołtarzem głównym, w kunsztownie wykonanej drewnianej ramie, znajduje się obraz olejny J. A. Schmidla z 1732 roku przedstawiający św. Michała, patrona kościoła. Ołtarz odrestaurowano i w 2007 roku przywrócono na jego pierwotne miejsce.
Katolícky kostol v Dobrej Nive je nielen najstaršou stavbou v obci, ale patrí aj medzi najstaršie stavby na Slovensku. Bol postavený v prvej polovici 13. storočia v románskom slohu ako trojloďová bazilika so štvorcovým presbytáriom a dvoma bočnými polkruhovými absidami a predstavanou vežou. Celá stavba pôsobí masívnym dojmom, múry sú hrubé a podopierajú ich zvonka oporné piliere. Na veži sú vzácne dvojité románske okná. Kostol má predstavanú predsieň. Strecha bola pôvodne šindľová, teraz je na veži medený plech a na ostatnej stavbe obyčajný farebný plech. V stredoveku kostol obohnali múrom a priekopou a slúžil ako bašta, v ktorej sa v čase nebezpečenstva ukrývali a bránili obyvatelia mestečka, ba ukladali tu i svoj majetok. Aj dnes je časť múru viditeľná. Zachovala sa i budova, ktorá slúži ako sklad.